Проекты

Проекты лаборатории генетики Института биологии КарНЦ РАН

  • Выживаемость популяций высших растений с различным уровнем панмиксии и генетического груза на северной границе их ареала
    (2006-2008 г.г., рук. Титов А.Ф., сорук. Лебедева О.Н., Прогр. фунд. иссл. Президиума РАН «Биоразнообразие и динамика генофондов»)
  • (2006-2008 г.г., рук. Лапшин Н.В., РФФИ, 06-05-64368_а)
  • Сравнительный анализ эколого-этологических механизмов адаптации трансконтинентальных мигрантов к обитанию в условиях экологического центра (оптимума) и периферии (субоптимума и пессимума) гнездового ареала на примере славковых птиц Европы
    (2015-2017 г.г., рук. Лапшин Н.В., РФФИ, 15-05-03493_а)
  • (2016-2018 г.г., рук. Галибина Н.А., РФФИ, 16-44-100639-р_а)
    Номер госрегистрации - АААА-А16-116041210037-4
  • «Молекулярно-генетические механизмы регуляции процессов сна в разных этнических группах населения Республики Карелия»
    (2018-2019 г.г., рук. Коломейчук С.Н., РФФИ, 18-413-100002а(р))
  • «Цикл сна-бодрствования и здоровье детского населения арктического региона»
    (2018-2018 г.г., рук. Коломейчук С.Н., Автономная некоммерческая организация «Экспертный Центр - Проектный Офис Развития Арктики (ПОРА)»)
  • «Полиморфизм, суточная динамика экспрессии ключевых генов биологических часов, рецепторов мелатонина и продукции мелатонина в патогенезе первичной открыто-угольной формы глаукомы»
    (2019-2021 г.г., РФФИ, 19-015-00329)
  • (2021-2023 г.г., рук. Жулай Г.А., РНФ, 21-75-00013)
    Аденозин киназа (ADK) является важным ферментом для поддержания клеточного метаболизма поскольку регулирует внутриклеточный и внеклеточный уровни аденозина, фосфорилируя его в 5’-аденозин монофосфат. ADK имеет 2 изоформы: локализующуюся в ядре длинную (ADK-L) и цитоплазматическую короткую (ADK-S). В настоящее время предполагается, что эти изоформы могут играть разное значение: если ADK-S отвечает в основном за рутинное удаление аденозина, то ADK-L может регулировать реакции метилирования, в том числе и ДНК. Внеклеточный аденозин оказывает иммуносупрессорное действие и является мишенью для лечения рака. В связи с этим исследование аденозин-конвертирующих ферментов может иметь терапевтическое значение. В проекте была проанализирована экспрессия ADK и транскриптов его изоформ ADK-L и ADK-S в периферической крови и ткани кишечника больных колоректальным раком (КРР). Обнаруженные результаты свидетельствуют о возможном участии ADK в патогенезе заболевания. Показано, что уровень экспрессии мРНК ADK не одинаково изменяется на периферии, где он был ниже контроля, и в опухоли, где он был выше контроля. Показано повышенное содержание отдельных клеточных популяций среди эффекторных клеток (CD8+ и CD4+) и супрессорных Т-клеток (Treg), указывающих на формирование иммунной супрессии у больных КРР как на периферии, так и в опухолевой ткани. Однако достоверной корреляционной связи между уровнем мРНК изоформ ADK и изменением субпопуляционного состава лимфоцитов выявлено не было.
    На втором этапе проекта проводилась оценка связи уровня мРНК изоформы ADK-L со степенью метилирования генов, связанных с развитием КРР: SEPT9, APC и FOXP3-TSDR в образцах опухолевой и нормальной ткани кишки больных КРР. Методом MS-HRM показано изменение уровня метилирования анализируемых генов в образцах опухолевой ткани. Достоверной корреляционной связи между уровнем мРНК ADK-L и степенью метилирования генов SEPT9, APC и FOXP3-TSDR у больных КРР не выявлено. Кроме того, было проанализировано функционирование лимфоцитов CD8+ и Treg-клеток в экспериментальных условиях, приближенных к микроокружению опухоли, в присутствии рекомбинантной ADK. Полученные результаты свидетельствуют о том, что rADK может усиливать экспрессию эктонуклеотидазы CD73 на CD8+ и CD4+ Т-клетках больных КРР. А также способствовать накоплению CTLA-4+Treg-клеток при со-культивировании Т-клеток и клеток колоректального рака (клеточные линии Caco-2 и SW837), вероятно посредством ADK-S.
  • Эпитранскриптомные модификации в развитии персистенции SARS-COV-2 у пациентов, перенесших COVID-19: участие N6-аденозин-метилтрансфераз клеток хозяина
    (2023-2024 г.г., рук. Балан О.В., РНФ, 23-25-10102, РНФ-ФВИ РК, №15-P23)
  • Последние изменения: 13 декабря 2023